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La emasculación (esterilidad masculina) de las plantas de cultivo objeto de la prueba o cultivo comercial. En el caso de microorganismos destinados a ser liberados (por ejemplo, los usados como inóculos con los que se impregnan semillas, con los que se pretende mejorar la nutrición por las raíces) se han diseñado varios mecanismos de inactivación génica o sistemas “suicidas” que tienden a evitar la multiplicación una vez que el microorganismo ha cumplido su misión. Estos sistemas de “contención o confinamiento” biológico que intentan controlar tecnológicamente la vida y la muerte de los agentes vivos liberados en ambientes complejos no son, sin embargo, efectivos al cien por cien[1].

Técnicas de rastreo de los OMG en el ambiente, consistentes en detectar algún gen marcador incorporado en el diseño genético. De esta forma, y a partir de muestras tomadas en el entorno de liberación, se puede seguir la pista del material genético, incluida la eventualidad de transferencias “horizontales” del ADN recombinante desde el OMG original a otros seres vivos del ecosistema[2]

En el caso de las plantas manipuladas con el gen de la toxina insecticida de la bacteria Bacillus thuringiensis (toxina Bt), y para evitar el resurgir de variedades de insectos resistentes, las agencias reguladoras están recomendando (con gran oposición por parte de los usuarios) que los cultivos se realicen en mosaicos compuestos de parcelas a base de plantas manipuladas mezcladas con parcelas de plantas sin manipular; estas últimas sirven como refugios para mantener una reserva de insectos no sometidos a la presión selectiva, y con ello se espera que no predominen los mutantes resistentes al insecticida[3]. La posibilidad de que el uso de plantas transgénicas portadoras del gen de la toxina Bt acentuara el riesgo de insectos resistentes ya fue advertida antes del cultivo comercial de estas plantas[4]. Existe una honda preocupación de que este problema se generalice[5], ya que no sólo frustraría las esperanzas depositadas en estas plantas, sino que amenazaría con inutilizar los usos tradicionales que muchos agricultores sensibles con el ambiente venían desarrollando al impregnar sus semillas con inóculos de la bacteria viva silvestre (B. thuringiensis).

La utilización de artrópodos (insectos, ácaros) genéticamente manipulados en programas de control integral de plagas, aunque en principio sería un estímulo a un tipo de práctica más ecológica, introduciría nuevos problemas relativos a la “seguridad” de dichos organismos una vez realizado su papel. Aquí también, al igual que con los microorganismos, se están intentando añadir rasgos de contención biológica, pero hay aún grandes lagunas de conocimiento básico sobre la ecología de insectos que recomiendan ir con mucha cautela en esta línea[6].